D’acord amb els diversos tipus d’associacions que s’hi poden inscriure, el Registre es divideix en tres seccions diferenciades, dedicades, respectivament, a les associacions en general, les estrangeres i les de caràcter esportiu, que segueixen el règim especial de la Llei de l’esport i que preveu concretament que les associacions esportives es classifiquen en clubs esportius, agrupacions esportives, seccions d’acció esportiva, i federacions esportives.