La documentació que es conserva a l’Arxiu Nacional d’Andorra integra diferents tipus de fons documentals: fons de l’Administració central (Consell General i Govern), fons de l’Administració local (comuns, quarts i veïnats), fons de l’Administració eclesiàstica, fons judicials (Tribunal de Corts, Tribunal de Batlles, Jutjat d’Apel·lacions, Tribunal Administratiu i Fiscal i Consell Superior de Justícia), els fons notarials, fons d’Institucions públiques i parapúbliques (FEDA), fons familiars i patrimonials, fons personals i col·leccions (audiovisuals i fotogràfics), fons d’associacions i fundacions, fons de partits polítics i associacions sindicals, fons d’empreses, fons cartogràfic, fons etnogràfic i fons estrangers que contenen documentació sobre Andorra o d’interès per Andorra.